Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A4P43007 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A4P43007 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms