Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NSG1P42857 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NSG1P42857 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NSG1P42857 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NSG1P42857 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NSG1P42857 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NSG1P42857 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NSG1P42857 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NSG1P42857 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NSG1P42857 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSG1P42857 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSG1P42857 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSG1P42857 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSG1P42857 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSG1P42857 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSG1P42857 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NSG1P42857 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSG1P42857 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSG1P42857 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSG1P42857 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NSG1P42857 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NSG1P42857 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSG1P42857 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSG1P42857 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NSG1P42857 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NSG1P42857 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NSG1P42857 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NSG1P42857 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NSG1P42857 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NSG1P42857 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NSG1P42857 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NSG1P42857 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NSG1P42857 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NSG1P42857 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSG1P42857 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSG1P42857 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSG1P42857 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSG1P42857 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSG1P42857 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSG1P42857 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NSG1P42857 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSG1P42857 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSG1P42857 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSG1P42857 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSG1P42857 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSG1P42857 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSG1P42857 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSG1P42857 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSG1P42857 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSG1P42857 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSG1P42857 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSG1P42857 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSG1P42857 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NSG1P42857 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NSG1P42857 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NSG1P42857 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NSG1P42857 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NSG1P42857 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NSG1P42857 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NSG1P42857 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NSG1P42857 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NSG1P42857 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NSG1P42857 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NSG1P42857 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NSG1P42857 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NSG1P42857 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSG1P42857 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSG1P42857 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSG1P42857 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSG1P42857 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSG1P42857 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSG1P42857 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSG1P42857 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSG1P42857 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSG1P42857 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSG1P42857 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSG1P42857 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NSG1P42857 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NSG1P42857 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms