Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CAP42336 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms