Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH1P40692 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH1P40692 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH1P40692 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH1P40692 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH1P40692 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH1P40692 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH1P40692 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH1P40692 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH1P40692 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH1P40692 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH1P40692 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH1P40692 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH1P40692 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH1P40692 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH1P40692 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH1P40692 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH1P40692 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH1P40692 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH1P40692 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH1P40692 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH1P40692 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH1P40692 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH1P40692 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH1P40692 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH1P40692 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH1P40692 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH1P40692 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH1P40692 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH1P40692 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH1P40692 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH1P40692 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH1P40692 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH1P40692 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH1P40692 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH1P40692 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH1P40692 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH1P40692 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH1P40692 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH1P40692 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH1P40692 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH1P40692 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH1P40692 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH1P40692 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH1P40692 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH1P40692 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH1P40692 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH1P40692 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH1P40692 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH1P40692 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH1P40692 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH1P40692 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH1P40692 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH1P40692 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH1P40692 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH1P40692 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH1P40692 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH1P40692 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH1P40692 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH1P40692 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH1P40692 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH1P40692 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH1P40692 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH1P40692 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH1P40692 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH1P40692 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH1P40692 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH1P40692 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH1P40692 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH1P40692 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH1P40692 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH1P40692 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH1P40692 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH1P40692 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH1P40692 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH1P40692 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH1P40692 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH1P40692 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH1P40692 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH1P40692 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH1P40692 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH1P40692 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH1P40692 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH1P40692 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH1P40692 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH1P40692 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH1P40692 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH1P40692 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH1P40692 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH1P40692 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH1P40692 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH1P40692 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH1P40692 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH1P40692 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH1P40692 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MLH1P40692 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MLH1P40692 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MLH1P40692 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MLH1P40692 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MLH1P40692 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms