Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL1P40616 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL1P40616 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL1P40616 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL1P40616 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL1P40616 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL1P40616 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL1P40616 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL1P40616 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL1P40616 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL1P40616 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL1P40616 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL1P40616 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL1P40616 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL1P40616 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL1P40616 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL1P40616 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL1P40616 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL1P40616 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL1P40616 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL1P40616 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL1P40616 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL1P40616 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL1P40616 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL1P40616 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL1P40616 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL1P40616 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL1P40616 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL1P40616 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL1P40616 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL1P40616 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL1P40616 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL1P40616 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL1P40616 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL1P40616 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL1P40616 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL1P40616 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL1P40616 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL1P40616 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL1P40616 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL1P40616 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL1P40616 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL1P40616 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL1P40616 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL1P40616 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL1P40616 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL1P40616 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL1P40616 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL1P40616 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL1P40616 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL1P40616 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL1P40616 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL1P40616 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL1P40616 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL1P40616 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL1P40616 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL1P40616 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL1P40616 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARL1P40616 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARL1P40616 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARL1P40616 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARL1P40616 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARL1P40616 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARL1P40616 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARL1P40616 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARL1P40616 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARL1P40616 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARL1P40616 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARL1P40616 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARL1P40616 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARL1P40616 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARL1P40616 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARL1P40616 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARL1P40616 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARL1P40616 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARL1P40616 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARL1P40616 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARL1P40616 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARL1P40616 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARL1P40616 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARL1P40616 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms