Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARGP37231 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARGP37231 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARGP37231 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARGP37231 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARGP37231 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARGP37231 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARGP37231 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPARGP37231 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARGP37231 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARGP37231 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARGP37231 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARGP37231 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARGP37231 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARGP37231 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARGP37231 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARGP37231 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARGP37231 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARGP37231 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARGP37231 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARGP37231 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARGP37231 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARGP37231 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARGP37231 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARGP37231 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPARGP37231 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARGP37231 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARGP37231 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARGP37231 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARGP37231 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARGP37231 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARGP37231 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARGP37231 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARGP37231 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARGP37231 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARGP37231 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARGP37231 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARGP37231 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARGP37231 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARGP37231 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARGP37231 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PPARGP37231 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARGP37231 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARGP37231 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARGP37231 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARGP37231 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARGP37231 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARGP37231 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARGP37231 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARGP37231 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARGP37231 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARGP37231 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms