Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD12P35452 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms