Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.993e-6■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.833e-6■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.743e-6■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 BANP-214ENST00000466847 772 ntTSL 218.75■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.543e-6■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 BANP-224ENST00000565242 801 ntTSL 313.65□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 HSF4-222ENST00000522870 1599 ntTSL 524.71■■□□□ 1.553e-7■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.523e-7■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 HSF4-214ENST00000521314 1555 ntTSL 524.32■■□□□ 1.483e-7■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 HSF4-224ENST00000523562 1839 ntTSL 223.7■■□□□ 1.383e-7■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 HSF4-203ENST00000517685 1249 ntTSL 523.53■■□□□ 1.363e-7■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 HSF4-220ENST00000522295 1539 ntTSL 523.27■■□□□ 1.323e-7■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 HSF4-201ENST00000434833 1568 ntTSL 1 (best)23.04■■□□□ 1.283e-7■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.23e-7■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 HSF4-216ENST00000521624 1358 ntTSL 1 (best)21.85■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 HSF4-204ENST00000517729 556 ntTSL 521.47■■□□□ 1.033e-7■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 HSF4-205ENST00000517750 546 ntTSL 517.02■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 HSF4-208ENST00000519224 637 ntTSL 514.95□□□□□ -0.023e-7■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.485e-10■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.55e-10■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.856e-8■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.616e-8■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.126e-8■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 RPA2-205ENST00000444045 682 ntTSL 515.32■□□□□ 0.046e-8■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.152e-6■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 TAF5L-205ENST00000477957 509 ntTSL 332.37■■■□□ 2.772e-6■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.12e-6■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 TAF5L-203ENST00000366675 4062 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 UGP2-223ENST00000493222 864 ntTSL 323.35■■□□□ 1.333e-27■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 UGP2-212ENST00000480679 505 ntTSL 523.35■■□□□ 1.333e-27■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 UGP2-227ENST00000497510 722 ntTSL 422.43■■□□□ 1.183e-27■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 UGP2-219ENST00000487469 1015 ntTSL 520.96■□□□□ 0.953e-27■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 UGP2-213ENST00000482668 645 ntTSL 320.34■□□□□ 0.853e-27■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.833e-27■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 UGP2-215ENST00000483461 495 ntTSL 420.05■□□□□ 0.83e-27■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 UGP2-205ENST00000466642 1023 ntTSL 419.33■□□□□ 0.683e-27■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 UGP2-217ENST00000484142 553 ntTSL 417.54■□□□□ 0.43e-27■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 UGP2-206ENST00000467400 717 ntTSL 517.51■□□□□ 0.393e-27■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 UGP2-214ENST00000483108 598 ntTSL 417.36■□□□□ 0.373e-27■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.243e-27■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 UGP2-220ENST00000487640 566 ntTSL 48.45□□□□□ -1.063e-27■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 DDX39A-216ENST00000591275 484 ntTSL 218.41■□□□□ 0.546e-8■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 DDX39A-218ENST00000592632 586 ntTSL 214.19□□□□□ -0.146e-8■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 DDX39A-220ENST00000593008 538 ntTSL 310.46□□□□□ -0.736e-8■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.424e-7■■■■■ 29.9
GTF2F1P35269 MAP4K3-206ENST00000437968 500 ntTSL 530.32■■■□□ 2.443e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.923e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.923e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 MAP4K3-204ENST00000429397 689 ntTSL 326.63■■□□□ 1.853e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 GNAZ-202ENST00000492538 652 ntTSL 424.05■■□□□ 1.443e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.046e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 TNFRSF12A-205ENST00000574699 583 ntTSL 221.48■■□□□ 1.033e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.033e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 TNFRSF12A-203ENST00000571351 1678 ntTSL 221.44■■□□□ 1.023e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 ITGB5-207ENST00000481591 1202 ntTSL 520.55■□□□□ 0.886e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.743e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.723e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.673e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 ITGB5-209ENST00000488466 971 ntTSL 518.08■□□□□ 0.486e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.283e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 TRIO-218ENST00000512070 8907 ntTSL 216.53■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.123e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.033e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.063e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 ITGB5-203ENST00000461306 577 ntTSL 412.58□□□□□ -0.46e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 AL109615.3-201ENST00000422059 2232 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.613e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.813e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 PHF23-207ENST00000573826 685 ntTSL 321.12■□□□□ 0.975e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.415e-8■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.132e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 KCNIP2-213ENST00000483385 736 ntTSL 320.03■□□□□ 0.83e-7■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 APLP2-209ENST00000527702 579 ntTSL 423.74■■□□□ 1.395e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 APLP2-220ENST00000533618 574 ntTSL 423.74■■□□□ 1.395e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 APLP2-214ENST00000530132 542 ntTSL 423.74■■□□□ 1.395e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 APLP2-218ENST00000533532 584 ntTSL 223.74■■□□□ 1.395e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 APLP2-221ENST00000533713 560 ntTSL 423.74■■□□□ 1.395e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 APLP2-213ENST00000529701 573 ntTSL 523.74■■□□□ 1.395e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 APLP2-208ENST00000526330 582 ntTSL 323.74■■□□□ 1.395e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 APLP2-224ENST00000534582 556 ntTSL 523.74■■□□□ 1.395e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 APLP2-217ENST00000533195 560 ntTSL 423.74■■□□□ 1.395e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 APLP2-223ENST00000534001 585 ntTSL 423.74■■□□□ 1.395e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 APLP2-216ENST00000532456 664 ntTSL 421.92■■□□□ 1.15e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.055e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.025e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 APLP2-219ENST00000533616 2041 ntTSL 220.41■□□□□ 0.865e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 APLP2-225ENST00000534761 551 ntTSL 518.92■□□□□ 0.625e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.315e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 APLP2-211ENST00000529235 537 ntTSL 416.43■□□□□ 0.225e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.125e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.065e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.982e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.632e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 GNB1-207ENST00000472614 708 ntTSL 224.56■■□□□ 1.522e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.072e-9■■■■■ 29.8
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 139.3 ms