Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CASQ1P31415 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
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