Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CLIP1P30622 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CLIP1P30622 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms