Protein–RNA interactions for Protein: P25441

RPC53, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, yeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC53	P25441	PTP3	YER075C	2787 nt		2.82	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	SIP3	YNL257C	3690 nt		2.82	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	YER091C-A	YER091C-A	222 nt		2.82	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	SPO11	YHL022C	1197 nt		2.82	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	PEX18	YHR160C	852 nt		2.82	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	YAP7	YOL028C	738 nt		2.82	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	BRX1	YOL077C	876 nt		2.82	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	GRX5	YPL059W	453 nt		2.82	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	SLM4	YBR077C	489 nt		2.82	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	YBR085C-A	YBR085C-A	258 nt		2.82	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	GCD10	YNL062C	1437 nt		2.82	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	COG3	YER157W	2406 nt		2.82	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	YLR001C	YLR001C	2589 nt		2.82	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	HAA1	YPR008W	2085 nt		2.81	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	MES1	YGR264C	2256 nt		2.81	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	YGR053C	YGR053C	852 nt		2.81	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	NOP19	YGR251W	591 nt		2.81	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	RPL27A	YHR010W	411 nt		2.81	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	YHR032W-A	YHR032W-A	180 nt		2.81	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	YHR213W	YHR213W	597 nt		2.81	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	YPT52	YKR014C	705 nt		2.81	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	YAR062W	YAR062W	597 nt		2.81	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	CWC24	YLR323C	780 nt		2.81	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	RPS16A	YMR143W	432 nt		2.81	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	YRO2	YBR054W	1035 nt		2.81	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	YPR014C	YPR014C	330 nt		2.81	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	CBP6	YBR120C	489 nt		2.81	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	snR43	snR43	209 nt		2.81	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	BFR1	YOR198C	1413 nt		2.81	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	SHS1	YDL225W	1656 nt		2.81	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	GEA1	YJR031C	4227 nt		2.8	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	NEW1	YPL226W	3591 nt		2.8	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	CAF120	YNL278W	3183 nt		2.8	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	DNL4	YOR005C	2835 nt		2.8	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	YCR090C	YCR090C	549 nt		2.8	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	YKL066W	YKL066W	444 nt		2.8	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	COQ10	YOL008W	624 nt		2.8	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	NUM1	YDR150W	8247 nt		2.8	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	NFT1	YKR103W	3657 nt		2.79	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	SRO77	YBL106C	3033 nt		2.79	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	YER189W	YER189W	369 nt		2.79	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	SFM1	YOR021C	642 nt		2.79	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	ISU1	YPL135W	498 nt		2.79	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	YBT1	YLL048C	4986 nt		2.79	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	ESC1	YMR219W	4977 nt		2.79	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	SGS1	YMR190C	4344 nt		2.78	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	snR76	snR76	109 nt		2.78	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	PRE1	YER012W	597 nt		2.78	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	RPL17B	YJL177W	555 nt		2.78	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	COX8	YLR395C	237 nt		2.78	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	ESF2	YNR054C	951 nt		2.78	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	YBR051W	YBR051W	351 nt		2.78	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	RPL36B	YPL249C-A	303 nt		2.78	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	NPR1	YNL183C	2373 nt		2.78	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	PDR1	YGL013C	3207 nt		2.78	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	SCY1	YGL083W	2415 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	PGD1	YGL025C	1194 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	EMC6	YLL014W	327 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	MRPL33	YMR286W	261 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	FPR1	YNL135C	345 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	CRS5	YOR031W	210 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	YBL005W-B	YBL005W-B	5268 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	PSK2	YOL045W	3306 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	PUF4	YGL014W	2667 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	MFB1	YDR219C	1398 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	YKL075C	YKL075C	1353 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	KAR9	YPL269W	1935 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	DAD1	YDR016C	285 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	YDR248C	YDR248C	582 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	ASG7	YJL170C	630 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	YET1	YKL065C	621 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	UBC12	YLR306W	567 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	URA5	YML106W	681 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	YNR034W-A	YNR034W-A	297 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	YOL085W-A	YOL085W-A	213 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	YOR050C	YOR050C	348 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	ADF1	YCL058W-A	342 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	RLI1	YDR091C	1827 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	MMS1	YPR164W	4224 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	BAS1	YKR099W	2436 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	NPR3	YHL023C	3441 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	YFL002W-B	YFL002W-B	1317 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	YGR161W-A	YGR161W-A	1317 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	YBL100W-A	YBL100W-A	1317 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	YCL020W	YCL020W	1317 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	TRZ1	YKR079C	2517 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	UTP15	YMR093W	1542 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	YDR203W	YDR203W	318 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	RTS3	YGR161C	792 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	RCE1	YMR274C	948 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	LCL1	YPL056C	306 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	PIS1	YPR113W	663 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	VPS41	YDR080W	2979 nt		2.74	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	MST27	YGL051W	705 nt		2.74	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	YHR050W-A	YHR050W-A	171 nt		2.74	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	YAL026C-A	YAL026C-A	438 nt		2.74	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	CAP1	YKL007W	807 nt		2.74	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	RPS1A	YLR441C	768 nt		2.74	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	TPS2	YDR074W	2691 nt		2.73	□□□□□ -1.97
RPC53	P25441	PBP4	YDL053C	558 nt		2.73	□□□□□ -1.97

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 97.8 ms