Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EIF4BP23588 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4BP23588 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms