Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms