Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERBB3P21860 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ERBB3P21860 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ERBB3P21860 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERBB3P21860 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERBB3P21860 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms