Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCP20941 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCP20941 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCP20941 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCP20941 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCP20941 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCP20941 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCP20941 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCP20941 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCP20941 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCP20941 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCP20941 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCP20941 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCP20941 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCP20941 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCP20941 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCP20941 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCP20941 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCP20941 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCP20941 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCP20941 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCP20941 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCP20941 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCP20941 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCP20941 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCP20941 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCP20941 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCP20941 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCP20941 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCP20941 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCP20941 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCP20941 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCP20941 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCP20941 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCP20941 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCP20941 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCP20941 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCP20941 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCP20941 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCP20941 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCP20941 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCP20941 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCP20941 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCP20941 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCP20941 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCP20941 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCP20941 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCP20941 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCP20941 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCP20941 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCP20941 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCP20941 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCP20941 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCP20941 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PDCP20941 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCP20941 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCP20941 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCP20941 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCP20941 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCP20941 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCP20941 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCP20941 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCP20941 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCP20941 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCP20941 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCP20941 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCP20941 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCP20941 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCP20941 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCP20941 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDCP20941 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDCP20941 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCP20941 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCP20941 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCP20941 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCP20941 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDCP20941 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCP20941 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PDCP20941 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCP20941 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDCP20941 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCP20941 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCP20941 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCP20941 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCP20941 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCP20941 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCP20941 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCP20941 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCP20941 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCP20941 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCP20941 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDCP20941 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCP20941 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCP20941 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCP20941 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCP20941 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCP20941 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCP20941 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCP20941 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCP20941 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms