Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATF3P18847 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATF3P18847 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ATF3P18847 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATF3P18847 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATF3P18847 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF3P18847 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF3P18847 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF3P18847 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF3P18847 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF3P18847 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF3P18847 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF3P18847 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF3P18847 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF3P18847 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF3P18847 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATF3P18847 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF3P18847 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF3P18847 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF3P18847 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF3P18847 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF3P18847 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF3P18847 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF3P18847 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATF3P18847 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATF3P18847 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATF3P18847 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATF3P18847 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATF3P18847 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATF3P18847 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATF3P18847 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATF3P18847 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATF3P18847 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATF3P18847 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATF3P18847 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATF3P18847 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATF3P18847 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATF3P18847 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATF3P18847 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF3P18847 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF3P18847 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF3P18847 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF3P18847 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF3P18847 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF3P18847 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF3P18847 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF3P18847 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF3P18847 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF3P18847 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF3P18847 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF3P18847 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF3P18847 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATF3P18847 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF3P18847 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF3P18847 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF3P18847 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF3P18847 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF3P18847 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF3P18847 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF3P18847 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF3P18847 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF3P18847 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF3P18847 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF3P18847 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATF3P18847 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATF3P18847 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ATF3P18847 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATF3P18847 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATF3P18847 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATF3P18847 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATF3P18847 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATF3P18847 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATF3P18847 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF3P18847 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF3P18847 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF3P18847 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF3P18847 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF3P18847 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF3P18847 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF3P18847 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF3P18847 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF3P18847 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF3P18847 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF3P18847 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF3P18847 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF3P18847 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF3P18847 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF3P18847 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF3P18847 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATF3P18847 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATF3P18847 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATF3P18847 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATF3P18847 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ATF3P18847 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ATF3P18847 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATF3P18847 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATF3P18847 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATF3P18847 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATF3P18847 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATF3P18847 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms