Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR1P18146 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR1P18146 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR1P18146 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EGR1P18146 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EGR1P18146 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EGR1P18146 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EGR1P18146 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR1P18146 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR1P18146 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR1P18146 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR1P18146 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR1P18146 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR1P18146 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR1P18146 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR1P18146 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR1P18146 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR1P18146 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR1P18146 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR1P18146 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR1P18146 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EGR1P18146 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR1P18146 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR1P18146 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR1P18146 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR1P18146 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR1P18146 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR1P18146 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR1P18146 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR1P18146 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR1P18146 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR1P18146 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR1P18146 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR1P18146 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR1P18146 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR1P18146 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR1P18146 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR1P18146 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR1P18146 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR1P18146 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EGR1P18146 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR1P18146 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR1P18146 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR1P18146 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR1P18146 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR1P18146 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR1P18146 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR1P18146 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR1P18146 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR1P18146 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR1P18146 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR1P18146 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR1P18146 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR1P18146 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR1P18146 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR1P18146 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR1P18146 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR1P18146 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR1P18146 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR1P18146 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR1P18146 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EGR1P18146 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EGR1P18146 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EGR1P18146 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EGR1P18146 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EGR1P18146 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EGR1P18146 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EGR1P18146 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EGR1P18146 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EGR1P18146 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EGR1P18146 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EGR1P18146 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EGR1P18146 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EGR1P18146 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EGR1P18146 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms