Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA1P17302 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA1P17302 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA1P17302 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA1P17302 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA1P17302 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA1P17302 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA1P17302 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA1P17302 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA1P17302 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA1P17302 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA1P17302 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA1P17302 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA1P17302 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA1P17302 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA1P17302 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA1P17302 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA1P17302 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJA1P17302 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA1P17302 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA1P17302 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA1P17302 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA1P17302 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA1P17302 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA1P17302 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA1P17302 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA1P17302 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA1P17302 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA1P17302 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA1P17302 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA1P17302 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA1P17302 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA1P17302 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA1P17302 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA1P17302 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA1P17302 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA1P17302 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA1P17302 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA1P17302 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GJA1P17302 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA1P17302 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA1P17302 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA1P17302 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA1P17302 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA1P17302 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA1P17302 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA1P17302 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJA1P17302 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJA1P17302 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJA1P17302 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJA1P17302 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJA1P17302 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA1P17302 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA1P17302 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA1P17302 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA1P17302 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA1P17302 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA1P17302 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA1P17302 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA1P17302 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA1P17302 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA1P17302 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA1P17302 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA1P17302 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA1P17302 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJA1P17302 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJA1P17302 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA1P17302 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA1P17302 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA1P17302 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA1P17302 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA1P17302 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA1P17302 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA1P17302 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA1P17302 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA1P17302 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA1P17302 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms