Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA1P15976 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA1P15976 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA1P15976 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA1P15976 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA1P15976 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA1P15976 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA1P15976 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA1P15976 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA1P15976 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA1P15976 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA1P15976 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA1P15976 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA1P15976 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA1P15976 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA1P15976 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA1P15976 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA1P15976 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA1P15976 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA1P15976 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA1P15976 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATA1P15976 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATA1P15976 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATA1P15976 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms