Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAV1P15498 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAV1P15498 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAV1P15498 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAV1P15498 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAV1P15498 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAV1P15498 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAV1P15498 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAV1P15498 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAV1P15498 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAV1P15498 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAV1P15498 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAV1P15498 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAV1P15498 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAV1P15498 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAV1P15498 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAV1P15498 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAV1P15498 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAV1P15498 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAV1P15498 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAV1P15498 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAV1P15498 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAV1P15498 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAV1P15498 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAV1P15498 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAV1P15498 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAV1P15498 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAV1P15498 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAV1P15498 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAV1P15498 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAV1P15498 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAV1P15498 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAV1P15498 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAV1P15498 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAV1P15498 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAV1P15498 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VAV1P15498 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VAV1P15498 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VAV1P15498 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAV1P15498 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAV1P15498 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAV1P15498 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAV1P15498 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAV1P15498 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAV1P15498 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAV1P15498 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAV1P15498 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAV1P15498 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAV1P15498 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAV1P15498 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAV1P15498 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAV1P15498 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAV1P15498 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAV1P15498 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAV1P15498 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAV1P15498 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAV1P15498 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAV1P15498 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAV1P15498 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAV1P15498 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAV1P15498 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAV1P15498 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAV1P15498 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VAV1P15498 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAV1P15498 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAV1P15498 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAV1P15498 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VAV1P15498 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAV1P15498 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VAV1P15498 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAV1P15498 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms