Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB1P14653 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB1P14653 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms