Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR2C1P13056 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms