Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BMP3P12645 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BMP3P12645 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BMP3P12645 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BMP3P12645 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BMP3P12645 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BMP3P12645 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BMP3P12645 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BMP3P12645 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BMP3P12645 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BMP3P12645 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BMP3P12645 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BMP3P12645 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BMP3P12645 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BMP3P12645 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BMP3P12645 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BMP3P12645 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BMP3P12645 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BMP3P12645 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BMP3P12645 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BMP3P12645 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BMP3P12645 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BMP3P12645 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BMP3P12645 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BMP3P12645 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BMP3P12645 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BMP3P12645 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BMP3P12645 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BMP3P12645 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BMP3P12645 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BMP3P12645 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BMP3P12645 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP3P12645 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP3P12645 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP3P12645 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP3P12645 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP3P12645 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP3P12645 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP3P12645 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP3P12645 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP3P12645 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP3P12645 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP3P12645 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP3P12645 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP3P12645 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP3P12645 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP3P12645 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP3P12645 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP3P12645 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP3P12645 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BMP3P12645 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BMP3P12645 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BMP3P12645 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BMP3P12645 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BMP3P12645 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BMP3P12645 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BMP3P12645 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BMP3P12645 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BMP3P12645 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BMP3P12645 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BMP3P12645 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BMP3P12645 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BMP3P12645 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BMP3P12645 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BMP3P12645 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP3P12645 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP3P12645 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP3P12645 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP3P12645 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP3P12645 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP3P12645 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP3P12645 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP3P12645 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP3P12645 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP3P12645 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP3P12645 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP3P12645 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP3P12645 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP3P12645 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP3P12645 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP3P12645 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP3P12645 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP3P12645 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP3P12645 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP3P12645 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BMP3P12645 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BMP3P12645 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BMP3P12645 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BMP3P12645 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BMP3P12645 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BMP3P12645 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BMP3P12645 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BMP3P12645 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BMP3P12645 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BMP3P12645 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BMP3P12645 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BMP3P12645 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BMP3P12645 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BMP3P12645 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BMP3P12645 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms