Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RLBP1P12271 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms