Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COX6A1P12074 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX6A1P12074 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms