Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms