Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DMDP11532 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DMDP11532 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DMDP11532 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DMDP11532 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DMDP11532 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DMDP11532 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DMDP11532 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DMDP11532 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DMDP11532 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DMDP11532 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DMDP11532 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DMDP11532 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DMDP11532 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DMDP11532 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DMDP11532 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DMDP11532 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DMDP11532 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DMDP11532 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DMDP11532 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DMDP11532 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DMDP11532 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DMDP11532 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DMDP11532 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DMDP11532 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DMDP11532 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DMDP11532 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DMDP11532 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DMDP11532 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DMDP11532 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DMDP11532 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DMDP11532 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DMDP11532 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DMDP11532 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DMDP11532 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DMDP11532 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DMDP11532 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DMDP11532 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DMDP11532 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DMDP11532 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DMDP11532 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DMDP11532 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DMDP11532 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DMDP11532 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DMDP11532 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DMDP11532 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DMDP11532 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DMDP11532 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DMDP11532 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DMDP11532 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DMDP11532 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DMDP11532 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DMDP11532 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DMDP11532 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DMDP11532 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DMDP11532 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DMDP11532 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DMDP11532 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DMDP11532 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DMDP11532 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DMDP11532 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DMDP11532 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DMDP11532 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DMDP11532 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DMDP11532 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DMDP11532 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DMDP11532 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DMDP11532 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DMDP11532 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DMDP11532 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DMDP11532 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DMDP11532 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DMDP11532 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DMDP11532 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DMDP11532 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DMDP11532 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DMDP11532 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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