Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI3P10071 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI3P10071 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI3P10071 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI3P10071 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI3P10071 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI3P10071 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI3P10071 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI3P10071 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLI3P10071 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLI3P10071 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLI3P10071 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
GLI3P10071 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GLI3P10071 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GLI3P10071 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GLI3P10071 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI3P10071 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI3P10071 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI3P10071 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI3P10071 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI3P10071 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI3P10071 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI3P10071 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI3P10071 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI3P10071 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI3P10071 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI3P10071 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI3P10071 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI3P10071 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI3P10071 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI3P10071 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI3P10071 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI3P10071 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI3P10071 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI3P10071 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI3P10071 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI3P10071 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI3P10071 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI3P10071 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI3P10071 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI3P10071 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI3P10071 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI3P10071 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI3P10071 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI3P10071 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI3P10071 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI3P10071 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI3P10071 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI3P10071 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI3P10071 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI3P10071 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI3P10071 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI3P10071 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI3P10071 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI3P10071 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI3P10071 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI3P10071 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI3P10071 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI3P10071 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI3P10071 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI3P10071 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI3P10071 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI3P10071 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI3P10071 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI3P10071 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI3P10071 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI3P10071 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI3P10071 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI3P10071 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI3P10071 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI3P10071 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI3P10071 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GLI3P10071 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GLI3P10071 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GLI3P10071 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GLI3P10071 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GLI3P10071 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GLI3P10071 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GLI3P10071 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GLI3P10071 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GLI3P10071 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GLI3P10071 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GLI3P10071 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GLI3P10071 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GLI3P10071 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GLI3P10071 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GLI3P10071 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GLI3P10071 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GLI3P10071 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GLI3P10071 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GLI3P10071 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GLI3P10071 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GLI3P10071 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GLI3P10071 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GLI3P10071 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GLI3P10071 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GLI3P10071 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GLI3P10071 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GLI3P10071 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GLI3P10071 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms