Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM10L2AP0DMW4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM10L2AP0DMW4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms