Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SAA2P0DJI9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAA2P0DJI9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAA2P0DJI9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAA2P0DJI9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAA2P0DJI9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAA2P0DJI9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAA2P0DJI9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAA2P0DJI9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAA2P0DJI9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAA2P0DJI9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAA2P0DJI9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SAA2P0DJI9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SAA2P0DJI9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms