Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC166P0CW27 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms