Protein–RNA interactions for Protein: P0C7P4

UQCRFS1P1, Putative cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRFS1P1P0C7P4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UQCRFS1P1P0C7P4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms