Protein–RNA interactions for Protein: P09848

LCT, Lactase-phlorizin hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 1,927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCTP09848 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCTP09848 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCTP09848 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCTP09848 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCTP09848 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCTP09848 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCTP09848 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCTP09848 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCTP09848 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCTP09848 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LCTP09848 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCTP09848 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCTP09848 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCTP09848 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCTP09848 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCTP09848 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCTP09848 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCTP09848 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCTP09848 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LCTP09848 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCTP09848 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCTP09848 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCTP09848 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCTP09848 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCTP09848 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCTP09848 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCTP09848 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCTP09848 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCTP09848 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCTP09848 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCTP09848 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LCTP09848 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCTP09848 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCTP09848 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCTP09848 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCTP09848 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCTP09848 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCTP09848 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCTP09848 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCTP09848 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCTP09848 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCTP09848 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCTP09848 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCTP09848 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCTP09848 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCTP09848 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCTP09848 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCTP09848 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCTP09848 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LCTP09848 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCTP09848 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCTP09848 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCTP09848 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCTP09848 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCTP09848 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCTP09848 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LCTP09848 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCTP09848 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCTP09848 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LCTP09848 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCTP09848 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCTP09848 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCTP09848 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCTP09848 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCTP09848 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCTP09848 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCTP09848 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCTP09848 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCTP09848 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LCTP09848 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCTP09848 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCTP09848 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCTP09848 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCTP09848 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCTP09848 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCTP09848 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LCTP09848 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LCTP09848 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCTP09848 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCTP09848 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCTP09848 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCTP09848 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCTP09848 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCTP09848 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCTP09848 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCTP09848 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCTP09848 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCTP09848 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCTP09848 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCTP09848 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCTP09848 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCTP09848 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCTP09848 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCTP09848 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCTP09848 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCTP09848 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCTP09848 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCTP09848 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCTP09848 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCTP09848 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms