Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI1P08151 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI1P08151 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI1P08151 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI1P08151 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI1P08151 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI1P08151 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI1P08151 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI1P08151 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI1P08151 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI1P08151 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI1P08151 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI1P08151 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI1P08151 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI1P08151 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI1P08151 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI1P08151 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI1P08151 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI1P08151 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI1P08151 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI1P08151 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI1P08151 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI1P08151 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI1P08151 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI1P08151 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI1P08151 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI1P08151 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI1P08151 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI1P08151 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI1P08151 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI1P08151 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI1P08151 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI1P08151 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI1P08151 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI1P08151 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI1P08151 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI1P08151 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI1P08151 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI1P08151 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI1P08151 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI1P08151 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI1P08151 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI1P08151 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI1P08151 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI1P08151 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLI1P08151 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI1P08151 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI1P08151 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI1P08151 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI1P08151 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI1P08151 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI1P08151 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI1P08151 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI1P08151 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI1P08151 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI1P08151 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI1P08151 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLI1P08151 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms