Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM2P07951 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM2P07951 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM2P07951 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM2P07951 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM2P07951 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM2P07951 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM2P07951 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM2P07951 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM2P07951 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM2P07951 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM2P07951 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM2P07951 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM2P07951 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM2P07951 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM2P07951 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM2P07951 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM2P07951 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPM2P07951 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM2P07951 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM2P07951 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM2P07951 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM2P07951 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM2P07951 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM2P07951 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM2P07951 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM2P07951 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM2P07951 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM2P07951 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM2P07951 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPM2P07951 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM2P07951 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM2P07951 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM2P07951 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM2P07951 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM2P07951 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM2P07951 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM2P07951 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM2P07951 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM2P07951 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM2P07951 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPM2P07951 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM2P07951 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM2P07951 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM2P07951 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM2P07951 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM2P07951 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM2P07951 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM2P07951 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM2P07951 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM2P07951 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM2P07951 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM2P07951 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM2P07951 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM2P07951 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM2P07951 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM2P07951 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM2P07951 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM2P07951 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM2P07951 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPM2P07951 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM2P07951 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM2P07951 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM2P07951 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM2P07951 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM2P07951 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM2P07951 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM2P07951 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM2P07951 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM2P07951 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM2P07951 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPM2P07951 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPM2P07951 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM2P07951 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM2P07951 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM2P07951 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM2P07951 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPM2P07951 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms