Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTMAP06454 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTMAP06454 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTMAP06454 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTMAP06454 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTMAP06454 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTMAP06454 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTMAP06454 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTMAP06454 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTMAP06454 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTMAP06454 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTMAP06454 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTMAP06454 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTMAP06454 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTMAP06454 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTMAP06454 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTMAP06454 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTMAP06454 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTMAP06454 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTMAP06454 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTMAP06454 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTMAP06454 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTMAP06454 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTMAP06454 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTMAP06454 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTMAP06454 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTMAP06454 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTMAP06454 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTMAP06454 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTMAP06454 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTMAP06454 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTMAP06454 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTMAP06454 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTMAP06454 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTMAP06454 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTMAP06454 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTMAP06454 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTMAP06454 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTMAP06454 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTMAP06454 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTMAP06454 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTMAP06454 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTMAP06454 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTMAP06454 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTMAP06454 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTMAP06454 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTMAP06454 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTMAP06454 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTMAP06454 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTMAP06454 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTMAP06454 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTMAP06454 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTMAP06454 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTMAP06454 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTMAP06454 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTMAP06454 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTMAP06454 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTMAP06454 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTMAP06454 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTMAP06454 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTMAP06454 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTMAP06454 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTMAP06454 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTMAP06454 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTMAP06454 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTMAP06454 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTMAP06454 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTMAP06454 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTMAP06454 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTMAP06454 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTMAP06454 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTMAP06454 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms