Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR3DP05423 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3DP05423 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms