Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3P05106 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB3P05106 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms