Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF2P04141 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF2P04141 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF2P04141 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF2P04141 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF2P04141 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF2P04141 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF2P04141 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF2P04141 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF2P04141 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF2P04141 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF2P04141 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF2P04141 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF2P04141 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF2P04141 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF2P04141 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF2P04141 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF2P04141 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF2P04141 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF2P04141 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF2P04141 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF2P04141 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF2P04141 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF2P04141 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF2P04141 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF2P04141 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF2P04141 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF2P04141 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF2P04141 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF2P04141 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF2P04141 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF2P04141 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF2P04141 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF2P04141 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF2P04141 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF2P04141 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF2P04141 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF2P04141 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF2P04141 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSF2P04141 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSF2P04141 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSF2P04141 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSF2P04141 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSF2P04141 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSF2P04141 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSF2P04141 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSF2P04141 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSF2P04141 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSF2P04141 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CSF2P04141 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSF2P04141 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSF2P04141 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSF2P04141 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSF2P04141 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF2P04141 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF2P04141 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF2P04141 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF2P04141 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF2P04141 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF2P04141 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF2P04141 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF2P04141 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF2P04141 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF2P04141 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSF2P04141 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSF2P04141 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CSF2P04141 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSF2P04141 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSF2P04141 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSF2P04141 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSF2P04141 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSF2P04141 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSF2P04141 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSF2P04141 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CSF2P04141 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSF2P04141 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms