Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZBED1O96006 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBED1O96006 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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