Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POP4O95707 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POP4O95707 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POP4O95707 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
POP4O95707 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POP4O95707 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POP4O95707 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POP4O95707 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
POP4O95707 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POP4O95707 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POP4O95707 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POP4O95707 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POP4O95707 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POP4O95707 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
POP4O95707 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POP4O95707 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POP4O95707 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
POP4O95707 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POP4O95707 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POP4O95707 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POP4O95707 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POP4O95707 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POP4O95707 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POP4O95707 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POP4O95707 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POP4O95707 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POP4O95707 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POP4O95707 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POP4O95707 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
POP4O95707 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POP4O95707 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POP4O95707 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POP4O95707 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POP4O95707 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POP4O95707 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POP4O95707 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POP4O95707 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POP4O95707 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POP4O95707 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POP4O95707 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POP4O95707 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
POP4O95707 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POP4O95707 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POP4O95707 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POP4O95707 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POP4O95707 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POP4O95707 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POP4O95707 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POP4O95707 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
POP4O95707 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
POP4O95707 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POP4O95707 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POP4O95707 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POP4O95707 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POP4O95707 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POP4O95707 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POP4O95707 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POP4O95707 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POP4O95707 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POP4O95707 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POP4O95707 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POP4O95707 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POP4O95707 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POP4O95707 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POP4O95707 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
POP4O95707 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POP4O95707 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POP4O95707 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POP4O95707 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POP4O95707 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POP4O95707 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
POP4O95707 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POP4O95707 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POP4O95707 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POP4O95707 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POP4O95707 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POP4O95707 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POP4O95707 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POP4O95707 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POP4O95707 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POP4O95707 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POP4O95707 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POP4O95707 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POP4O95707 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POP4O95707 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POP4O95707 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POP4O95707 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POP4O95707 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POP4O95707 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POP4O95707 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POP4O95707 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POP4O95707 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POP4O95707 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POP4O95707 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POP4O95707 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POP4O95707 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POP4O95707 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POP4O95707 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POP4O95707 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POP4O95707 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms