Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
POLR1AO95602 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms