Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTDNEP1O95476 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1O95476 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms