Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPINO95295 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms