Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms