Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN5O75503 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN5O75503 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN5O75503 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN5O75503 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN5O75503 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN5O75503 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN5O75503 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN5O75503 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN5O75503 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN5O75503 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN5O75503 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN5O75503 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN5O75503 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN5O75503 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN5O75503 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN5O75503 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN5O75503 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN5O75503 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN5O75503 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN5O75503 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN5O75503 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN5O75503 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN5O75503 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN5O75503 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN5O75503 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN5O75503 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN5O75503 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN5O75503 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN5O75503 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN5O75503 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN5O75503 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN5O75503 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN5O75503 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN5O75503 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN5O75503 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN5O75503 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN5O75503 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN5O75503 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN5O75503 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN5O75503 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN5O75503 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN5O75503 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN5O75503 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN5O75503 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN5O75503 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN5O75503 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN5O75503 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN5O75503 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN5O75503 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN5O75503 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN5O75503 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN5O75503 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN5O75503 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN5O75503 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN5O75503 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms