Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSO75390 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSO75390 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSO75390 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSO75390 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSO75390 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSO75390 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSO75390 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSO75390 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSO75390 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSO75390 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSO75390 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSO75390 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSO75390 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSO75390 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSO75390 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSO75390 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSO75390 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSO75390 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSO75390 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSO75390 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CSO75390 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSO75390 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSO75390 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSO75390 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSO75390 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSO75390 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSO75390 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSO75390 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSO75390 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSO75390 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSO75390 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSO75390 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSO75390 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSO75390 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSO75390 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSO75390 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSO75390 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSO75390 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSO75390 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSO75390 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSO75390 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSO75390 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSO75390 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSO75390 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSO75390 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSO75390 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSO75390 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSO75390 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSO75390 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSO75390 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSO75390 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSO75390 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSO75390 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSO75390 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSO75390 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSO75390 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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