Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNND1O60716 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND1O60716 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms