Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GMDSO60547 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GMDSO60547 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GMDSO60547 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GMDSO60547 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GMDSO60547 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GMDSO60547 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GMDSO60547 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GMDSO60547 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GMDSO60547 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GMDSO60547 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GMDSO60547 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GMDSO60547 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GMDSO60547 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GMDSO60547 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GMDSO60547 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GMDSO60547 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GMDSO60547 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GMDSO60547 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GMDSO60547 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GMDSO60547 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GMDSO60547 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GMDSO60547 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GMDSO60547 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GMDSO60547 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GMDSO60547 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GMDSO60547 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GMDSO60547 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GMDSO60547 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GMDSO60547 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GMDSO60547 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GMDSO60547 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GMDSO60547 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GMDSO60547 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GMDSO60547 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GMDSO60547 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GMDSO60547 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GMDSO60547 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GMDSO60547 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GMDSO60547 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GMDSO60547 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GMDSO60547 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GMDSO60547 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GMDSO60547 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GMDSO60547 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GMDSO60547 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GMDSO60547 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GMDSO60547 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GMDSO60547 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GMDSO60547 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GMDSO60547 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GMDSO60547 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GMDSO60547 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GMDSO60547 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms