Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GRIN3BO60391 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIN3BO60391 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN3BO60391 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms